MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013156	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013156	ATAA	2	8	44	51	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013156	ATT	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013156	ATT	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013156	TGA	2	6	117	122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809974
7	NC_013156	TTG	2	6	135	140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809974
8	NC_013156	CTT	2	6	192	197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809974
9	NC_013156	AT	3	6	233	238	50 %	50 %	0 %	0 %	256809974
10	NC_013156	GA	3	6	300	305	50 %	0 %	50 %	0 %	256809974
11	NC_013156	GCA	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809974
12	NC_013156	AATA	2	8	390	397	75 %	25 %	0 %	0 %	256809974
13	NC_013156	TCA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013156	AAGG	2	8	464	471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013156	AATT	2	8	499	506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013156	T	6	6	581	586	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
17	NC_013156	TCAA	2	8	609	616	50 %	25 %	0 %	25 %	256809975
18	NC_013156	GCT	2	6	684	689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809975
19	NC_013156	GCATCT	2	12	699	710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256809975
20	NC_013156	CTC	2	6	755	760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
21	NC_013156	CAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
22	NC_013156	AAC	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
23	NC_013156	T	6	6	839	844	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
24	NC_013156	TTC	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
25	NC_013156	TGTT	2	8	865	872	0 %	75 %	25 %	0 %	256809975
26	NC_013156	ACA	2	6	900	905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
27	NC_013156	CAT	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809975
28	NC_013156	CTG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809975
29	NC_013156	TTA	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809975
30	NC_013156	CAG	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809975
31	NC_013156	ACA	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
32	NC_013156	CAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
33	NC_013156	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809975
34	NC_013156	T	6	6	1204	1209	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
35	NC_013156	ATA	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
36	NC_013156	T	6	6	1224	1229	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
37	NC_013156	T	6	6	1236	1241	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
38	NC_013156	TCC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
39	NC_013156	T	6	6	1287	1292	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
40	NC_013156	CCAA	2	8	1293	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	256809975
41	NC_013156	T	6	6	1305	1310	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
42	NC_013156	TCT	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
43	NC_013156	ACT	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809975
44	NC_013156	TAA	2	6	1426	1431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
45	NC_013156	T	6	6	1433	1438	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
46	NC_013156	T	7	7	1477	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
47	NC_013156	CTT	3	9	1486	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
48	NC_013156	TCC	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
49	NC_013156	T	6	6	1517	1522	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
50	NC_013156	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
51	NC_013156	CTT	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
52	NC_013156	T	6	6	1589	1594	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
53	NC_013156	AAT	2	6	1596	1601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
54	NC_013156	T	6	6	1622	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
55	NC_013156	TCT	2	6	1632	1637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
56	NC_013156	TTC	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
57	NC_013156	TAA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013156	AT	3	6	1760	1765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013156	CTT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013156	TAAT	2	8	1782	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013156	A	6	6	1814	1819	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
62	NC_013156	AT	3	6	1905	1910	50 %	50 %	0 %	0 %	256809976
63	NC_013156	T	6	6	1918	1923	0 %	100 %	0 %	0 %	256809976
64	NC_013156	CTTG	2	8	1954	1961	0 %	50 %	25 %	25 %	256809976
65	NC_013156	A	7	7	1998	2004	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
66	NC_013156	A	6	6	2015	2020	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
67	NC_013156	GTT	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809976
68	NC_013156	T	7	7	2041	2047	0 %	100 %	0 %	0 %	256809976
69	NC_013156	AAT	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809976
70	NC_013156	GA	3	6	2058	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	256809976
71	NC_013156	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809976
72	NC_013156	GAT	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809976
73	NC_013156	A	6	6	2141	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
74	NC_013156	A	7	7	2158	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
75	NC_013156	A	6	6	2170	2175	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
76	NC_013156	TAAA	2	8	2211	2218	75 %	25 %	0 %	0 %	256809976
77	NC_013156	T	6	6	2227	2232	0 %	100 %	0 %	0 %	256809976
78	NC_013156	A	7	7	2235	2241	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
79	NC_013156	TAT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809976
80	NC_013156	GAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809976
81	NC_013156	TGA	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809976
82	NC_013156	GA	4	8	2347	2354	50 %	0 %	50 %	0 %	256809976
83	NC_013156	GAA	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809976
84	NC_013156	CAT	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809976
85	NC_013156	A	6	6	2458	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
86	NC_013156	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809976
87	NC_013156	A	6	6	2513	2518	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
88	NC_013156	ATTA	2	8	2605	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013156	TA	3	6	2698	2703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013156	A	6	6	2832	2837	100 %	0 %	0 %	0 %	256809977
91	NC_013156	TGA	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013156	TTTC	2	8	3066	3073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013156	AAT	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013156	T	7	7	3180	3186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013156	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013156	TCA	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013156	TCA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013156	ATC	3	9	3283	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013156	TAA	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013156	A	6	6	3313	3318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013156	T	6	6	3343	3348	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
102	NC_013156	T	6	6	3394	3399	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
103	NC_013156	CTG	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809978
104	NC_013156	TA	3	6	3447	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	256809978
105	NC_013156	GCT	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809978
106	NC_013156	CTT	2	6	3478	3483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
107	NC_013156	TAT	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
108	NC_013156	AT	3	6	3657	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	256809978
109	NC_013156	T	6	6	3684	3689	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
110	NC_013156	TAA	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
111	NC_013156	CAA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809978
112	NC_013156	ATTTC	2	10	3836	3845	20 %	60 %	0 %	20 %	256809978
113	NC_013156	CTT	2	6	3947	3952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
114	NC_013156	CTC	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
115	NC_013156	CTT	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
116	NC_013156	TTAC	2	8	4039	4046	25 %	50 %	0 %	25 %	256809978
117	NC_013156	AAC	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809978
118	NC_013156	CTA	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809978
119	NC_013156	ATT	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
120	NC_013156	GAG	2	6	4208	4213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809978
121	NC_013156	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
122	NC_013156	CT	3	6	4288	4293	0 %	50 %	0 %	50 %	256809978
123	NC_013156	CATCTA	2	12	4307	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809978
124	NC_013156	TCC	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
125	NC_013156	TCC	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
126	NC_013156	CTAA	2	8	4459	4466	50 %	25 %	0 %	25 %	256809978
127	NC_013156	CCT	3	9	4502	4510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
128	NC_013156	TCC	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
129	NC_013156	CTT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
130	NC_013156	TCT	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
131	NC_013156	AGT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809978
132	NC_013156	AT	3	6	4619	4624	50 %	50 %	0 %	0 %	256809978
133	NC_013156	CTTT	2	8	4634	4641	0 %	75 %	0 %	25 %	256809978
134	NC_013156	TC	3	6	4715	4720	0 %	50 %	0 %	50 %	256809978
135	NC_013156	GTT	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809978
136	NC_013156	ATT	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
137	NC_013156	AAT	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
138	NC_013156	AAT	2	6	4920	4925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
139	NC_013156	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
140	NC_013156	TAA	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
141	NC_013156	GAT	2	6	5058	5063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809978
142	NC_013156	TC	3	6	5074	5079	0 %	50 %	0 %	50 %	256809978
143	NC_013156	T	6	6	5145	5150	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
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151	NC_013156	TCT	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
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260	NC_013156	TAAAA	2	10	9928	9937	80 %	20 %	0 %	0 %	256809982
261	NC_013156	A	6	6	9934	9939	100 %	0 %	0 %	0 %	256809982
262	NC_013156	TTTAA	2	10	9953	9962	40 %	60 %	0 %	0 %	256809982
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270	NC_013156	TAA	2	6	10485	10490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809982
271	NC_013156	AAT	2	6	10495	10500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809982
272	NC_013156	A	7	7	10537	10543	100 %	0 %	0 %	0 %	256809982
273	NC_013156	CTTA	2	8	10545	10552	25 %	50 %	0 %	25 %	256809982
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